Иван Шавкунов и другие...

Да, у Шавкуновых были какие то проблемы с кунгурскими посадскими.
Сперва приведем документ. Это челобитная кунгурского посадского Емельяна Удальчикова в Сибирский приказ от 12 марта 1706г.

Державнейший Царь Государь милостивейший. В прошлом 705-м году приволокся я к Москве для челобитья на кунгурских земских бурмистров и таможенных голов в воровстве их и в краже твоей Государевы казны и как я приволокся для вышеписанного челобитья и уведал кунгурец Кузьма Вертипрахов, что я приволокся для того челобитья и в том году бил челом тебе Государю на меня он Кузма знатное дело, что чо по их науке земских бурмистров и таможенных голов и подал в Преображенском приказе челобитную,
чтоб я на них не бил челом и не подавал на них бурмистров тебе Государю в Преображенском приказе и в Сибирском приказе и в Ынгермоландской Каннцелярии; а он Кузма в прошлом же 705-м году, от оточной [так в тексте] ставки с бурмистром са Фролом Шавкуновым из Сибирского приказу збежал уведав свою вину;а я раб твой прислан ис Преображенского в Сибирский приказ и сидя помираю голодною смертию. Всемилостивейший Государь, прошу Вашего величества вели Государь из Сибирского приказу в Преображенское для взятья тех белых и черных челобитен послать Память, которые взяты у Алексея Байкова для подлинного их земских бурмистров и таможенных голов воровства, а что их воровства и то писано имянно в тех челобитных, а те челобитные
в Преображенском у подьячего Петра Исакова.Вашего величества нижайший раб Кунгурец посадской человек Емельян Удальчиков 1706 марта в 12 день.
К сей челобитной тобольской служилой человек Федор Иевлев вместо кунгурца посадцкого человека Емельяна Удальчикова по его велению руку приложил .
Послать против сего челобитья о присылке тех челобитей в Преображенской приказ память.

РГАДА, ф.214, оп.5, д.969.л.1-1об.

а он Кузма в прошлом же 705-м году, от оточной [так в тексте] ставки с бурмистром са Фролом Шавкуновым из Сибирского приказу збежал уведав свою вину

Здесь просто ошибка в тексте и речь идет об очной ставке Фрола Шавкунова и Кузьмы Вертипрахова в Сибирском приказе. Очная ставка в те времена так и называлась—очная ставка. Кузьма Вертипрахов представлял интересы кунгурских земских бурмистров, но что-то пошло не так. Видимо, Кузьма Вертипрахов и Фрол Шавкунов не сумели предварительно встретиться и договориться и из за этого Кузьма Вертипрахов сбежал от очной ставки с Фролом Шавкуновым.

Емельян Удальчиков пишет:
"а я раб твой прислан ис Преображенского в Сибирский приказ и сидя помираю голодною смертию"
То есть, первоначально Емельян Удальчиков бил челом в Преображенском приказе, но потом, по каким то причинам, дело его было передано в Сибирский приказ вместе с самим Емельяном. При этом, челобитные кунгурских посадских свидетельствующие о "воровстве" земских бурмистров не были переданы из Преображенского приказа в Сибирский.
Емельян Удальчиков пишет:
"прошу Вашего величества вели Государь из Сибирского приказу в Преображенское для взятья тех белых и черных челобитен послать Память, которые взяты у Алексея Байкова для подлинного их земских бурмистров и таможенных голов воровства, а что их воровства и то писано имянно в тех челобитных, а те челобитные в Преображенском у подьячего Петра Исакова."

Надо понимать так, что Емельян Удальчиков не находился под караулом, а просто был задержан в Москве до окончания рассмотрения дела, но при этом он не имел средств к существованию и умирал от голода.

Мы видим, что первоначально дело о преступлениях кунгурских бурмистров рассматривалось в Преображенском приказе. Что такое Преображенский приказ?
Вот что пишут об этом историки:

"Преображенский приказ, центральное государственное учреждение России в конце 17 — начале 18 вв. Создан Петром I в 1686 в подмосковном селе Преображенском для управления Преображенским и Семеновским полками; использовался царём в борьбе за власть против царевны Софьи. С 1695 стал называться П. п.; ведал охраной порядка в Москве, расследовал особо важные судебные дела и др. С 1697 получил исключительное право следствия и суда по политическим преступлениям. Находился в непосредственном ведении царя. Известным ограничением функций П. п. было учреждение Тайной канцелярии (1718—26), которая рассматривала дела чрезвычайной важности (дело царевича Алексея и др.). Деятельность П. п. была направлена на подавление антикрепостнических выступлений народа (до 70% всех дел), борьбу с противниками преобразований Петра I. Упразднён в апреле 1729. Начальники (судьи) П. п.: князь Ф. Ю. Ромодановский (1686—1717), князь И. Ф. Ромодановский (1718—29)."

(Голикова Н. Б., Политические процессы при Петре I, М., 1957.)

Источник:https://www.booksite.ru/fulltext/1/001/008/092/480.htm

Младший Шавкунов "достойный" продолжатель своего старшего брата Ивана!